序列比对

如何绘制漂亮的多序列比对图片

1.下载多序列比对软件 下载链接:https://pan.baidu.com/s/1RYDRQws8DUYLhB7rvXoiGg 2.序列比对 3.序列比对结果保存 输出结果保存为aln后缀 4.图片绘制 网站:http://espript.ibcp.fr/ESPript/ESPript/index.php a.开始新的工作(自己的) b.输入需要的文...

11、序列比对

概念:如果两个序列享有一个共同的进化上的祖先,则这两个序列是同源的(homologous) 直系同源:若一一个基因原先存在于某个物种,而而该物种分化为了两个物种,两个物种中的相同的基因功能未变化; 旁系同源的序列因基因复制(gene duplication)而被区分开(separated):若生生物体中的某个基因被复制了,功能改变了,那么两个副本序列就是旁...

生物信息学: 导论与方法 | 总结笔记

课程链接:生物信息学: 导论与方法 1 导论与历史 1.1 1-1 什么是生物信息学 1.2 1-2 生物信息学历史 1.3 1-3 中国大陆的生物信息学 2 序列比对 2.1 2-1 序列比对中的基本概念 2.2 2-2 利用动态规划进行全局比对 2.3 2-3 从全局比对到局部比对 2.4 2-4 考虑仿射空位罚分的序列比对,以及...

SAMTOOLS使用 SAM BAM文件处理

 【怪毛匠子 整理】 samtools学习及使用范例,以及官方文档详解 #第一步:把sam文件转换成bam文件,我们得到map.bam文件   system"samtools view -bS map.sam > map.bam";   #第二步:sort 一下 BAM 文件,得到map.sorted.bam   system"samtools so...