Bedtools

pybedtools:在Python中使用BEDTools

I have a Python, I have a BEDTools. Ah,pybedtools! 前言 pybedtools 是采用 Python 对BEDTools 软件的封装和扩展。为啥要用pybedtools ,而不是直接使用BEDTools 呢? 当然是我们想在Python 使用 BEDTools 啦() Why pybedtools? 作者也...

bedtools 的安装与使用

1) 安装 bedtools 提供了3种安装方式 从google code 下载源代码进行安装 利用系统中的包管理工具进行安装, 比如cnetos 下的yum, ubuntu下的apt-get, mac 下的homebrew 从github下载源代码,进行安装 由于访问不了google code,又想编译安装,就从github上下载最新版:https:...

一文学会conda基本使用

Conda 简介 Conda 是一个开源的包管理系统和环境管理系统,可在 Windows、macOS 和 Linux 上运行。 Conda 可快速安装、运行和更新包及其依赖项。 Conda 可以轻松地在计算机上创建、保存、加载和切换环境。 它是为 Python 程序而创造的,但它可以打包和分发任何语言的软件。 简单来说,conda可以让我们一行命令安装更新...