基因

NamiRNA

NamiRNA属于miRNA。 在转录过程中通过与 3ʹ 或 5ʹ 非翻译区(3ʹ 或 5ʹ UTR)、启动子和增强子区域的碱基配对,激活靶基因。 在哺乳动物中,miRNAs/NamiRNAs 控制着一半以上的蛋白质编码基因。 来源:https://cmbl.biomedcentral.com/articles/10.1186/s11658-021-002...

第二章 基因芯片

DNA微阵列   DNA微阵列(DNA microarray)又称DNA阵列、DNA芯片和基因芯片(gene chip),是一块数平方公分面积布放数千或数万个核酸探针的特殊玻璃片或硅芯片。   检体中的DNA、cDNA或RNA与探针结合后,借由荧光或电流等方式侦测,即可提供大量基因序列信息。研究人员应用基因芯片可以在同一时间定量分析大量(成千上万)的基因...

如何计算每个基因的覆盖度与深度

 如何计算每个基因的覆盖度与深度,有多种方法可以完成。如下演示使用samtools depth命令方法   1. 数据下载 1.1 Fastq文件下载   从NCBI下载Illumina Hiseq X Ten平台的RNA-Seq数据SRR7751429信息如上图所示。 1.1.1 使用wget命令(sra-toolkit工具下载太慢)下载 wget f...

第三章 RNA测序

  RNA测序(RNA Sequencing,简称RNA-Seq,也被称为全转录物组鸟枪法测序Whole Transcriptome Shotgun Sequencing,简称WTSS),是基于二代测序技术研究转录组学的方法,可以快速获取给定时刻的一个基因组中RNA的种类和数量。 RNA-Seq有助于查看基因的不同转录本、转录后修饰、基因融合、突变/S...